49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3119 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  87.73 
 
 		 269 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  76.21 
 
 		 269 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  62.41 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  30.29 
 
 		 451 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  30.59 
 
 		 488 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  32.18 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  27.86 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  35.54 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  27.9 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  29.3 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  30.69 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  29.7 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  30.45 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  27.41 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  27.49 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  29.8 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  27.8 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  25.48 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  26.83 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  28.5 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  26.63 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  27.97 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  29.91 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  26.49 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  34.26 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  32.46 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  26.46 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  29.37 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  33.02 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  33.02 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  33.02 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  26.42 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  29.45 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  27.44 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  29.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  29.41 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  26.9 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  26.47 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  26.09 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  28.44 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  31.82 
 
 		 203 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>