58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4370 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 		 293 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  68.54 
 
 		 273 aa  341  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  68.54 
 
 		 273 aa  341  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  66.32 
 
 		 296 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  32.06 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  33.65 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  30.59 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  34.47 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  30.08 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  33.65 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  31.73 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  31.07 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  27.72 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  32.29 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  35.75 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  29.69 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  35.87 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  27.5 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  32.14 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  30.69 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  25.29 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  29.41 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  31.11 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  32.13 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  28.24 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  33.66 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  26.83 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  29.92 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  27.18 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  31.86 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  30.17 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  30.41 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  26.75 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  38.94 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  31.05 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  27.35 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  29.58 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  31.37 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  26.27 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  31.8 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  26.8 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  24.73 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  28 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  30.62 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  29.52 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  36.52 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  31.49 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  37.04 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  29.17 
 
 		 208 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15223  predicted protein  25.87 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  32.46 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  35.09 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  29.82 
 
 		 331 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  34.21 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  32.71 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  22.81 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>