47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33955 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  100 
 
 
488 aa  1007    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  32.5 
 
 
208 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  30.28 
 
 
304 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  29.87 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  29.8 
 
 
269 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  29.69 
 
 
269 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  27.97 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  27.8 
 
 
289 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  28 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  27.75 
 
 
264 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  28.87 
 
 
293 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  35.64 
 
 
258 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  43.48 
 
 
267 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  35 
 
 
274 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  29.31 
 
 
261 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  29.31 
 
 
261 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  34.29 
 
 
273 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  32.03 
 
 
261 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  28.49 
 
 
263 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  31.03 
 
 
267 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  41.43 
 
 
279 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  50 
 
 
257 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  27.37 
 
 
253 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  35.58 
 
 
331 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  42.11 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  47.73 
 
 
271 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  46.3 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  25.79 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  31.18 
 
 
260 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  38.46 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  28.29 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  28.4 
 
 
262 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  34.31 
 
 
271 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  37.31 
 
 
256 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  25.83 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  34.38 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  43.75 
 
 
261 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  39.06 
 
 
270 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  34.38 
 
 
264 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  40.82 
 
 
264 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>