19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45361 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  100 
 
 
331 aa  680    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  39.73 
 
 
451 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  36.55 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  29.96 
 
 
269 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  26.83 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  27.08 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  27.24 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  28.79 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  29.17 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  31.36 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  33.85 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  28.3 
 
 
257 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  32.8 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  35.58 
 
 
488 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  27.45 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  29.82 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  27.38 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  27.95 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  29.17 
 
 
269 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>