23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48600 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  100 
 
 		 451 aa  909    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  39.73 
 
 		 331 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  38.95 
 
 		 208 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  31.32 
 
 		 269 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  31.99 
 
 		 269 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  29.87 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  28.29 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  27.55 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  27.87 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  33.1 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  29.63 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  25.67 
 
 		 293 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  27.32 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  27.37 
 
 		 269 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  32.26 
 
 		 257 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  24.06 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  24.35 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  31.03 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  25.68 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  25.84 
 
 		 262 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  35.21 
 
 		 270 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  26.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>