69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5181 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 		 293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  57.02 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  52.55 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  47.25 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  48.35 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  48.18 
 
 		 264 aa  225  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  47.31 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  49.09 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  44.23 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  37.09 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  43.67 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  40.83 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  41.29 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  39.35 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  39.33 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  38.24 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  36.69 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  40.29 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  39.53 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  40.34 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  39.01 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  38.58 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  38.22 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  44.79 
 
 		 273 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  39.56 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  35.16 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  34.27 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  34.93 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  34.66 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  33.58 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  33.33 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  42.41 
 
 		 178 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  34.81 
 
 		 271 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  40.98 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  31.07 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  32.17 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  33.95 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  33.98 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  30.88 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  29.78 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  34.41 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  29.78 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  30.85 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  30.85 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  31.34 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  27.14 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  28.97 
 
 		 488 aa  58.9  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  40.32 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  32.41 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  27.98 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  26.23 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  26.24 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  25.45 
 
 		 451 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  27.45 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  51.85 
 
 		 62 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  24.14 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.91 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  27.21 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  30.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.89 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  30.68 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.74 
 
 		 157 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  27.59 
 
 		 157 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.37 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.93 
 
 		 162 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>