106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2564 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  327  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.36 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  41.9 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.09 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  34.42 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.17 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.66 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  39.77 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  37.37 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  42.55 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  34 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.66 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  57.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.03 
 
 
157 aa  57.4  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.31 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.8 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.43 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  24.75 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  41.76 
 
 
270 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  32.67 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  44.71 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.92 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  35.21 
 
 
273 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.47 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32.05 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
227 aa  52.4  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.14174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.16 
 
 
218 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.51 
 
 
284 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.08 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.73 
 
 
189 aa  51.2  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.37 
 
 
218 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  23.19 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.02 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  39.77 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  39.02 
 
 
224 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.92 
 
 
229 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.69 
 
 
212 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.94 
 
 
185 aa  47.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.58 
 
 
224 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.47 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
225 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  34.39 
 
 
275 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  28.47 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  29.51 
 
 
257 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.3 
 
 
230 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  38.46 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  30.95 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  31.93 
 
 
256 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  29.76 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  29.76 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0730  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.63 
 
 
236 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.776939  hitchhiker  0.000590903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.5 
 
 
210 aa  45.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
224 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
224 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.49 
 
 
226 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  28.74 
 
 
203 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  30.68 
 
 
293 aa  44.3  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  36.47 
 
 
215 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 
195 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  34.55 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  35.65 
 
 
253 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  35.65 
 
 
253 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.04 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2349  hypothetical protein  31.13 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  35.4 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  28.48 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  35.4 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2732  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.83 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.01 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.74 
 
 
225 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.95 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  33.04 
 
 
256 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  35.9 
 
 
90 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  34.88 
 
 
253 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  29.66 
 
 
232 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  30.83 
 
 
168 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  34.09 
 
 
267 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.38 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.78 
 
 
194 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.94 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  35.8 
 
 
266 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  28.8 
 
 
264 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.13 
 
 
219 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
191 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  33.77 
 
 
193 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  31.07 
 
 
220 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  31.07 
 
 
220 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>