57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4539 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  50.95 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  51.11 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  50.37 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  51.48 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  49.59 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  48.45 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  44.35 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  48.76 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  43.44 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  41.85 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  36.43 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  38.13 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  40.08 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  40.64 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  37.04 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  44.62 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  33.82 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  36.92 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  39.83 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  38.87 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  35.94 
 
 		 275 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  38.49 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  35.43 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  35.02 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  35.82 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  33.82 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  43.65 
 
 		 178 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  35.14 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  33.7 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  35.98 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  37.25 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  35.38 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  32.82 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33.65 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  33 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  34.57 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  33.72 
 
 		 277 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  30.97 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  27.38 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  32.98 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  30.71 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  30.71 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  30.3 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  29.3 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  29.69 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  29.88 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  29.05 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  36.89 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  54.9 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  32.37 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  29.15 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  35.62 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  31.2 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  33.33 
 
 		 488 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  35.21 
 
 		 451 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>