77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1034 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  56.63 
 
 
265 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  47.01 
 
 
264 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  45.28 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  45.91 
 
 
256 aa  209  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  45.15 
 
 
264 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  41.76 
 
 
267 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  35.71 
 
 
261 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  44.07 
 
 
275 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  40.91 
 
 
293 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  41.9 
 
 
258 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  43.44 
 
 
260 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  37.94 
 
 
267 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  39.06 
 
 
270 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  41.18 
 
 
263 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  36.29 
 
 
258 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  38.17 
 
 
271 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  32.55 
 
 
264 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  37.35 
 
 
256 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  40.53 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  36.19 
 
 
253 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  37.01 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  37.12 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  33.71 
 
 
258 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  39.01 
 
 
263 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  32.95 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  33.59 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  34.48 
 
 
271 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  30.51 
 
 
267 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  33.21 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  33.72 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  29.45 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  32.55 
 
 
260 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  34.12 
 
 
289 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  34.76 
 
 
275 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  31.4 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  33.59 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  29.12 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  30.99 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  25.29 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  27.94 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  33.54 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  28.35 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  26.32 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  26.32 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  27.41 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  29.39 
 
 
397 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  27.41 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  32.23 
 
 
304 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  30.39 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  30.15 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  27.5 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  23.63 
 
 
311 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  30.89 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  27.37 
 
 
451 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  25.79 
 
 
488 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  30.17 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.07 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  31.25 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  29.17 
 
 
331 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  30.95 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  30.95 
 
 
458 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  32.14 
 
 
427 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  29.35 
 
 
422 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  29.07 
 
 
219 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  27.27 
 
 
424 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  29.89 
 
 
427 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.65 
 
 
157 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>