32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3564 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  71.7 
 
 		 424 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  71.33 
 
 		 427 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  93.44 
 
 		 427 aa  820    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5406  hypothetical protein  98.13 
 
 		 427 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  93.44 
 
 		 458 aa  820    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5048  hypothetical protein  93.65 
 
 		 458 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.319901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3861  hypothetical protein  93.91 
 
 		 427 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  863    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2448  hypothetical protein  93.63 
 
 		 458 aa  819    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  73.63 
 
 		 422 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  70.82 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  71.33 
 
 		 427 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  71.56 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  71.56 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  71.56 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  71.56 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  71.56 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.77 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.03 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6047  hypothetical protein  36.58 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  33.45 
 
 		 476 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  38.75 
 
 		 221 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.18 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.18 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  37.18 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.18 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.18 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2920  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.18 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.7 
 
 		 188 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.33 
 
 		 233 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  37.18 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  35.9 
 
 		 238 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>