31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0945 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
444 aa  884    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54.27 
 
 
468 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  34.66 
 
 
424 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5048  hypothetical protein  36.56 
 
 
458 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.319901 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  34.98 
 
 
427 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  33.64 
 
 
427 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  33.64 
 
 
458 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3861  hypothetical protein  33.64 
 
 
427 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2448  hypothetical protein  33.58 
 
 
458 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755524  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  34.43 
 
 
422 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  33.03 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5406  hypothetical protein  35.22 
 
 
427 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  34.59 
 
 
427 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  34.35 
 
 
427 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  34.35 
 
 
427 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  34.35 
 
 
427 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  34.35 
 
 
427 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  34.35 
 
 
427 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  33.26 
 
 
427 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6047  hypothetical protein  39.18 
 
 
405 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  40.11 
 
 
476 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  35.83 
 
 
238 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  35.83 
 
 
241 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.83 
 
 
241 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.83 
 
 
241 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.83 
 
 
241 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.83 
 
 
230 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  34.17 
 
 
238 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  30.77 
 
 
233 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
227 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.03 
 
 
221 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>