28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0026 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 468 aa  929    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54.27 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  35.75 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  34.98 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  34.77 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  34.77 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3861  hypothetical protein  34.77 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5406  hypothetical protein  35.7 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  34.83 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  34.83 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  34.83 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  34.83 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  34.83 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  35.12 
 
 		 427 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5048  hypothetical protein  34.65 
 
 		 458 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.319901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2448  hypothetical protein  34.57 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  34.61 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  34.99 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  35.6 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6047  hypothetical protein  30.37 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  38.59 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  38.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  38.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  38.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  38.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.37 
 
 		 230 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  38.37 
 
 		 238 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  36.78 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>