39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2271 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  980    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  32.19 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3861  hypothetical protein  32.19 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  33.45 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5406  hypothetical protein  33.45 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  34.94 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5048  hypothetical protein  34.23 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.319901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2448  hypothetical protein  31.72 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  31.58 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  34.66 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  30.72 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6047  hypothetical protein  37.56 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  33.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  33.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  33.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  33.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  33.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.59 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  33.47 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  33.86 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.11 
 
 		 444 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.41 
 
 		 230 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  34.41 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.69 
 
 		 230 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.41 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.41 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.41 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  34.41 
 
 		 238 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.35 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  33.7 
 
 		 238 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.96 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  34.04 
 
 		 232 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  29.75 
 
 		 214 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.26 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  31.96 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 		 202 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5414  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 		 245 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 227 aa  44.3  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.14174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>