98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5094 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.95 
 
 
226 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  47.56 
 
 
230 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0192  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  47.75 
 
 
224 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.76 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0730  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.97 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.776939  hitchhiker  0.000590903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.09 
 
 
235 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  32.52 
 
 
232 aa  121  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.39 
 
 
225 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.99 
 
 
224 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
227 aa  118  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.14174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  34.72 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.62 
 
 
229 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.86 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  34.42 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  35.38 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.34 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.11 
 
 
224 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  31 
 
 
225 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.57 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  30.57 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  30.57 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  30.57 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  30.57 
 
 
225 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.24 
 
 
161 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.05 
 
 
184 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  28.9 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.8 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.22 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  41.77 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0018  hypothetical protein  46.75 
 
 
79 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.64 
 
 
191 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.61 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.61 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.61 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.97 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.83 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  31.13 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.86 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  34.09 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  36.67 
 
 
476 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.27 
 
 
142 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.47 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.7 
 
 
188 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
222 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.95 
 
 
219 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 
219 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 
219 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.66 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.67 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  38.3 
 
 
90 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.38 
 
 
156 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.95 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.17 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.99 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  36.26 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.86 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  36.26 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  37.8 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.05 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.86 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  30.23 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  31.76 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  33.73 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  31.4 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.57 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  36.05 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35.53 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.65 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  36 
 
 
270 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.41 
 
 
195 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.47 
 
 
162 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  30.63 
 
 
153 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  26.55 
 
 
153 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  34.23 
 
 
133 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1870  hypothetical protein  32.26 
 
 
214 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536067  normal  0.115149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>