170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5033 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  97.88 
 
 
189 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  92.59 
 
 
189 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  92.59 
 
 
189 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  92.06 
 
 
189 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  92.06 
 
 
189 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.67 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.55 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.89 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.68 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  36.84 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.04 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.61 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.84 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.05 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.05 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  36.28 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.69 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.6 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.04 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.31 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.51 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.79 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.63 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  28.12 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  28.12 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.79 
 
 
202 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.65 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  30.97 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  34.51 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.04 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
218 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.33 
 
 
224 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
219 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.23 
 
 
230 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  39.76 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  34.34 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  30.7 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  31.9 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  31.46 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  34.48 
 
 
90 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  31.9 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  31.9 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.61 
 
 
213 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
221 aa  54.7  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.82 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  43.37 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  35.34 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  34.94 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  32.48 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  30.17 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.82 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  39.76 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.82 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  32.48 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.22 
 
 
191 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  36.14 
 
 
168 aa  52  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  32.77 
 
 
238 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.77 
 
 
230 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  32.77 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.77 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.77 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.77 
 
 
241 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  36.14 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 
284 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0192  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.16 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  29.82 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  34.94 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.36 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.08 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  28.68 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  30.77 
 
 
238 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.38 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
221 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  31.25 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.94 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.05 
 
 
224 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.64 
 
 
219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.64 
 
 
219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>