111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03462 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  100 
 
 
90 aa  183  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  50.57 
 
 
189 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  50.57 
 
 
189 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.58 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.77 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.89 
 
 
214 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.72 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.65 
 
 
209 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.53 
 
 
219 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.78 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.78 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.78 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.64 
 
 
199 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.78 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.64 
 
 
219 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9832  predicted protein  40.91 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.63 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
219 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.77 
 
 
217 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.82 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.04 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  39.77 
 
 
219 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 
225 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
219 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.58 
 
 
202 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.65 
 
 
219 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  35.23 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.46 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  38.37 
 
 
235 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  27.91 
 
 
147 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.11 
 
 
195 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.5 
 
 
205 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.23 
 
 
239 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.34 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  36.36 
 
 
224 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
213 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00510  hypothetical protein  37.14 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.798456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  31.46 
 
 
232 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.14174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  35.63 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.95 
 
 
222 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
218 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
207 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 
218 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.36 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  37.8 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.09 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.3 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.07 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 
210 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.46 
 
 
224 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  39.08 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.52 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  33.77 
 
 
208 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  32.1 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  33.77 
 
 
215 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  33.33 
 
 
257 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 
222 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.55 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.63 
 
 
221 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2391  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.89 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.1 
 
 
227 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.43 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  33.73 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1159  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.12 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.772846  hitchhiker  0.00322732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5116  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.71 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  35.9 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  33.71 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  37.35 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.89 
 
 
160 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.33 
 
 
216 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 
159 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  32.95 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
229 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  32.29 
 
 
225 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  34.12 
 
 
243 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
233 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.05 
 
 
209 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 
219 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.49 
 
 
242 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.59 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.49 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>