115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2544 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 
242 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.3 
 
 
250 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  26.83 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  45.45 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.18 
 
 
158 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  36.47 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.79 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  36.71 
 
 
133 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  38.16 
 
 
161 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.07 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.07 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  30.95 
 
 
144 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.25 
 
 
152 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  34.12 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.23 
 
 
153 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 
158 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.18 
 
 
157 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  37.04 
 
 
158 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.25 
 
 
152 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.83 
 
 
184 aa  55.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.97 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.26 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
135 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  37.5 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  34.12 
 
 
168 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  37.93 
 
 
154 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.18 
 
 
147 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.07 
 
 
166 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.11 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.29 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  30.38 
 
 
155 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.77 
 
 
175 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.16 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  45.45 
 
 
175 aa  52.4  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  27.43 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
222 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  28.23 
 
 
161 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.83 
 
 
198 aa  52  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  41.77 
 
 
147 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.33 
 
 
187 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.74 
 
 
219 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  33.78 
 
 
222 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  40.26 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.2 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.16 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  32.14 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  35.8 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.9 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.9 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.9 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  30.65 
 
 
157 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.23 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  26.92 
 
 
159 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  28.15 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  28.15 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1081  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.89 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 
158 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.66 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.97 
 
 
170 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.68 
 
 
147 aa  48.9  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.87 
 
 
191 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.21 
 
 
159 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.91 
 
 
201 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.34 
 
 
157 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.75 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  29.9 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  25.69 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  36.25 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  32.91 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.79 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  30.3 
 
 
365 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  34.72 
 
 
160 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.06 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.78 
 
 
151 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.05 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.05 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.86 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  26.52 
 
 
163 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  24.35 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  25.84 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  29.87 
 
 
149 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.21 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  25.84 
 
 
253 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  25.84 
 
 
253 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.23 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.74 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  31.65 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.38 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.24 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>