103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2990 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 226 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0824  hypothetical protein  45.7 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.259993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.62 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.99 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.81 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.34 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.14 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.43 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.22 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  36.67 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.46 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  36.75 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.05 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.21 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.46 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  39.64 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.07 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  33.56 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 147 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  33.72 
 
 		 158 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  34.91 
 
 		 133 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.48 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.04 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.04 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.67 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  32.97 
 
 		 154 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.67 
 
 		 147 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.29 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  32.54 
 
 		 1020 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  36.07 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.4 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  36.46 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.51 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.79 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.73 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.78 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.47 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.65 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.01 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.2 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  30.85 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  30.85 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  27.81 
 
 		 159 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.79 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  31.79 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.94 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  35.58 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  35.16 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  35.16 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 189 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.97 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.08 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  37.65 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  34.07 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.24 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.43 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.73 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.84 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  35.09 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  36.47 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.82 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  34.18 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.04 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  26.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.74 
 
 		 158 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.08 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.34 
 
 		 219 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 		 159 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.61 
 
 		 189 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>