23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0824 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.259993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.7 
 
 		 226 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  34.72 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  28.7 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  31.76 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  38.67 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  37.6 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  31.76 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  28.71 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  23.53 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  27.34 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.27 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  36.99 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.45 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.67 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 242 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.42 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>