162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2418 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  339  1e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  42.24 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  40.54 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  40.54 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.76 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  31.25 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  33.93 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  33.93 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  40.51 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  34.19 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  33.64 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  33.64 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  33.64 
 
 		 253 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.32 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  37.8 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  31.13 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.55 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  35.14 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.55 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  35.96 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  35.4 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.39 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  34.88 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.82 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  28.86 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.35 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  31.3 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.13 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.13 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  39.76 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  34.57 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  35.63 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.1 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.96 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  34.57 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.05 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  36.36 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  34.57 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.95 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.62 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.88 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  32.11 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 1020 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  34.25 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  33.72 
 
 		 208 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  31.33 
 
 		 219 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  34.94 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.37 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.95 
 
 		 220 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  27.27 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  37.8 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  34.07 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.14 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  34.07 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.91 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.71 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.76 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  26.73 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.23 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.43 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.29 
 
 		 242 aa  48.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  32 
 
 		 215 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0824  hypothetical protein  28.7 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.259993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.45 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 		 218 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  32.17 
 
 		 215 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.94 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.1 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.09 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.78 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  34.57 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.09 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.09 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  26.05 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  32.14 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.55 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  35.63 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  43.24 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>