94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3140 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 		 152 aa  296  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  98.03 
 
 		 152 aa  292  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  57.52 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  47.4 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.66 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  49.35 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.67 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  50.44 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  47.41 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  41.06 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  55.67 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  39.22 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  44.04 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  49 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  42.48 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  44.68 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  43.88 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.6 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  45.71 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  46.28 
 
 		 175 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.48 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  29.14 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.62 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  39.36 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  36.67 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.73 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.51 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.44 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  44.07 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  39.82 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  39.39 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  53.57 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.25 
 
 		 242 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.55 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.02 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.46 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  35.87 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  36.05 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  31.16 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03747  hypothetical protein  53.97 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.71 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.96 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.82 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  37.97 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.51 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 189 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  42.71 
 
 		 285 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  39.39 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.21 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.51 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35.8 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.63 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  33.63 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  33.06 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.22 
 
 		 214 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  36.23 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  26.32 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  30.86 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  38.24 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  34.38 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.47 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.47 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  30.49 
 
 		 190 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 		 217 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.94 
 
 		 202 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1081  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.78 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  36 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  34.82 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  31.94 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  32.93 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.47 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  30.97 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  37.21 
 
 		 219 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  28.81 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>