140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0252 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  291  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.94 
 
 
193 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.94 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  39.1 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  36.84 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.85 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  40.4 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  37.11 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  36.94 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.89 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.09 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  33.98 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.36 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  39.09 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  42.55 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.44 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  40.18 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.77 
 
 
219 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  41.41 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.55 
 
 
188 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.48 
 
 
217 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.94 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  31.13 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.13 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.3 
 
 
219 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  30.12 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.53 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  37.75 
 
 
270 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.11 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.13 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.89 
 
 
219 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.34 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  32.58 
 
 
233 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.06 
 
 
221 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  35.8 
 
 
219 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.9 
 
 
219 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  36.56 
 
 
207 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  43.24 
 
 
167 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.11 
 
 
239 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.46 
 
 
207 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  33.07 
 
 
194 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.72 
 
 
219 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  33.07 
 
 
194 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  34.04 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.38 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.77 
 
 
210 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.43 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.41 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.43 
 
 
224 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  30.43 
 
 
225 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.72 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.64 
 
 
209 aa  50.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.17 
 
 
237 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
194 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.05 
 
 
225 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.83 
 
 
202 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35.35 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  28.47 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.03 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  29.57 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  37.63 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  29.57 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  29.57 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  29.57 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  29.06 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.32 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  31.06 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
195 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  27.78 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.18 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.02 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.26 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5414  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.68 
 
 
245 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.62 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.77 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.95 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  28.12 
 
 
232 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.33 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.41 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.97 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.81 
 
 
213 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  32.76 
 
 
262 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0018  hypothetical protein  34.62 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294318  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.68 
 
 
219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.68 
 
 
219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  38.1 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
219 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>