74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48233 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  100 
 
 
270 aa  540  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  35.94 
 
 
167 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.61 
 
 
193 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  35.95 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  38.1 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  40.87 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  37.61 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.16 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.64 
 
 
185 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.23 
 
 
157 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  32.64 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  38.99 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.73 
 
 
157 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  44.32 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  37.18 
 
 
151 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.66 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.96 
 
 
157 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.41 
 
 
188 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  34.78 
 
 
157 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.1 
 
 
190 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  34.93 
 
 
172 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.96 
 
 
202 aa  55.8  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.23 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.11 
 
 
142 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  30.63 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32.38 
 
 
147 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.92 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.07 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.26 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  30.51 
 
 
167 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  31.3 
 
 
221 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2349  hypothetical protein  36.99 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147875  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.14 
 
 
219 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.02 
 
 
189 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.71 
 
 
189 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.47 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.56 
 
 
189 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  37.31 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.12 
 
 
219 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.75 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.18 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.27 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.89 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.28 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.53 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.53 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  31.53 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.53 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  31.4 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.53 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  31.53 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.28 
 
 
219 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 
210 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  32.88 
 
 
207 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  29.06 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  30.95 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.95 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.91 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.78 
 
 
166 aa  42.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5414  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.11 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.43 
 
 
170 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 
205 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>