64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2018 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  337  5.9999999999999996e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  71.51 
 
 
175 aa  213  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  56.73 
 
 
190 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  44.77 
 
 
188 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.12 
 
 
185 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  39.53 
 
 
185 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  40.59 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  37.89 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  36.78 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  36.94 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.14 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.44 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.47 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  36.47 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.68 
 
 
162 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  32.08 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  35.48 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  43.18 
 
 
270 aa  58.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  36.18 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  39.33 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.19 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.81 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
189 aa  47.8  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  37.93 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.82 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  33.63 
 
 
232 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.74 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 
219 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31 
 
 
217 aa  45.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.08 
 
 
209 aa  44.7  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  33.72 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.11 
 
 
205 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.11 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.14 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
284 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  28.29 
 
 
233 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  33.33 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.13 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.08 
 
 
209 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  31.75 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  33.75 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.18 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  35.9 
 
 
248 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  35.9 
 
 
248 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 
235 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
191 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.32 
 
 
218 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.62 
 
 
202 aa  40.8  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>