165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1486 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
221 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.32 
 
 
227 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.47 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  36.5 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  39.42 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5414  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.13 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  32.47 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.81 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.99 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2920  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.64 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3015  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  40.98 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.86 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  37.86 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  37.86 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.86 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.86 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.86 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  36.89 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.32 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.17 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.52 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.27 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.19 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.76 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.34 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32.29 
 
 
147 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.84 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.94 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.7 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.74 
 
 
205 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.7 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 
219 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2349  hypothetical protein  28.82 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  32.59 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.88 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  33.64 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
142 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35.05 
 
 
98 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1870  hypothetical protein  32.69 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536067  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.18 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.72 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.32 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  36.19 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.14 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.28 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.09 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  32.14 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
284 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.51 
 
 
202 aa  52  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  37.5 
 
 
273 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  33.64 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  33.64 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  34.62 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.17 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.48 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  34.29 
 
 
166 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  33.64 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.25 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  33.64 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.58 
 
 
152 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.06 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  29.55 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  36.59 
 
 
168 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.57 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.29 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.24 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  32.71 
 
 
253 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.76 
 
 
190 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.82 
 
 
152 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  29.71 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.59 
 
 
162 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  41.49 
 
 
172 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.32 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  28.85 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  35.29 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>