124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1795 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
219 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  79.63 
 
 
220 aa  349  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  49.03 
 
 
216 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  43.13 
 
 
219 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.03 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  43.13 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.13 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.13 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  42.13 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  40.65 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.18 
 
 
216 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  41.04 
 
 
253 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.25 
 
 
216 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  38.97 
 
 
209 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.09 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.04 
 
 
215 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.5 
 
 
216 aa  154  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  40.57 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.46 
 
 
214 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.48 
 
 
222 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 
1020 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  39.41 
 
 
217 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  40.19 
 
 
216 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  40.29 
 
 
221 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.29 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  37.75 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.93 
 
 
218 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.34 
 
 
215 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  38.76 
 
 
214 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  38.83 
 
 
220 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  38.83 
 
 
220 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  37.27 
 
 
253 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  37.27 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  37.27 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  34.39 
 
 
248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  34.39 
 
 
248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.58 
 
 
224 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.38 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  39.05 
 
 
221 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.11 
 
 
210 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.91 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.19 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.87 
 
 
189 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.33 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.33 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.33 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 
191 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.33 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  34.44 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.33 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  45.33 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.68 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.52 
 
 
159 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  32.97 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.74 
 
 
206 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  39.47 
 
 
266 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  26.67 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  24.85 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 
170 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.79 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  33.33 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  33.33 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.43 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.24 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.46 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.11 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  28.74 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  30.4 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  31.03 
 
 
126 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.58 
 
 
218 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  36.25 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.19 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  27.92 
 
 
169 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  34.62 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  34.62 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.2 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  33.64 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  39.56 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.94 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  30.83 
 
 
365 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  26.89 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.08 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.97 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  33.77 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.18 
 
 
195 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  29.13 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  37.5 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.85 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.89 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  37.18 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.88 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.82 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>