136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1707 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  99.55 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  68.25 
 
 		 215 aa  308  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  69.55 
 
 		 220 aa  307  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  69.55 
 
 		 220 aa  307  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  70.65 
 
 		 1020 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  69.38 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  73.08 
 
 		 220 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  66.99 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  66.34 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.98 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  63.94 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  61.4 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  64.88 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.2 
 
 		 216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  64.38 
 
 		 222 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  63.64 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.98 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.73 
 
 		 216 aa  274  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  62.56 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.02 
 
 		 222 aa  271  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  62.09 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.98 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.09 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.09 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  62.44 
 
 		 215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.24 
 
 		 215 aa  266  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.9 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  60.66 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  62.56 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  55.17 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  55.17 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  60.68 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  55.83 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  55.83 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  55.34 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  56.59 
 
 		 218 aa  234  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.31 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.32 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  33 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.87 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  32.46 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.96 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  34.55 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.41 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.08 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  25.89 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.48 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  25.89 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.37 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  33.33 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.52 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.17 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.16 
 
 		 149 aa  51.6  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.1 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  28.57 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.88 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.39 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  28.57 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  39.74 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  37.04 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.67 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.55 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  34.88 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.24 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  33.77 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.46 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  32.17 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.25 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  30 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.66 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  24.73 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  23.96 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.28 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.36 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.9 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.37 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.9 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.37 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  26.04 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.37 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.9 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  25 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.96 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.05 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>