118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1232 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  100 
 
 		 158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  54.64 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  43.92 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  48.6 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  37.23 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  47.66 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.97 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.21 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  34.03 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.68 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.52 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  32.41 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  34.44 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  33.78 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.78 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.23 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.21 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  36.21 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  34.23 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.18 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.82 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.65 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.73 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.92 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.76 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.14 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.04 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  36.27 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  36.27 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  36.27 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.36 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.36 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.21 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  39.45 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.29 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  33.93 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.26 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  30.86 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.15 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.46 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.21 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.53 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.39 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  32.41 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.78 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  33.12 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.85 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.31 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 1020 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.45 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  38.46 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.05 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2201  hypothetical protein  29.13 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.05 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.05 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  35.19 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.95 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.31 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  36.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.84 
 
 		 214 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  40.58 
 
 		 209 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  33.88 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.9 
 
 		 217 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.6 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.8 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.26 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  39.47 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.79 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.51 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.51 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.51 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.78 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  33.04 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.74 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  30.08 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  29.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.37 
 
 		 214 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.04 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.65 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  38.16 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  28.48 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  26.36 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  26.36 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.89 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.53 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>