86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0782 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  46.02 
 
 
170 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.29 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.57 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  44.9 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.8 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.52 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  32.65 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.97 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  36.7 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.39 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  34.01 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  36.75 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  30.61 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.91 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  41.05 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.75 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.73 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.2 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  38.3 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.76 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  34.96 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.58 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  35.09 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.89 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.76 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.56 
 
 
135 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.97 
 
 
202 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 
204 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
206 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.75 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  27.83 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.82 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  39.24 
 
 
219 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  31.9 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.09 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.51 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.77 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  31.71 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.77 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.77 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.41 
 
 
242 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  33.75 
 
 
204 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
219 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  33.75 
 
 
204 aa  48.5  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.51 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.58 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  34.18 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  25.52 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2201  hypothetical protein  33.6 
 
 
147 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735697  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.63 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  35.05 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.77 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.21 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  29.9 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  35.34 
 
 
285 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.89 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  29.73 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.51 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.4 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  29.73 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.93 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  31.71 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.38 
 
 
250 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.35 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.11 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  31.4 
 
 
215 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  44.44 
 
 
59 aa  41.2  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.71 
 
 
219 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.94 
 
 
202 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 
191 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  32.73 
 
 
206 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>