147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  308  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  35.44 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  40.65 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.01 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  35.33 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.55 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.38 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  40 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  43.01 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  31.18 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  41.82 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.11 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.23 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.67 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  39.22 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.78 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  37.29 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.12 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.03 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.82 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.05 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  35.1 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.13 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  43.12 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.9 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  39.08 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  33.65 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  32.47 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.9 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.75 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  39.53 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.95 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.46 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.28 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  40.43 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.57 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.56 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.93 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  43.21 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  36.79 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  39.08 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  29.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  34.01 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  33.87 
 
 		 215 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  32 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  34.78 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.41 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  35.9 
 
 		 253 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.65 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  35.96 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.04 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.9 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  31.43 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.58 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2201  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.7 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.63 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  38.89 
 
 		 365 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  37.8 
 
 		 206 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  27.81 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5190  hypothetical protein  35.35 
 
 		 437 aa  47.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726392  normal  0.528978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.73 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.03 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  40.28 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.74 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.53 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.68 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.68 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  32.91 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1081  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.05 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.05 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.72 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.19 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  32.91 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  32.91 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.27 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.91 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  32.1 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 		 214 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>