78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0241 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 		 175 aa  329  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  98.64 
 
 		 147 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  78.23 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  43.67 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  41.89 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.17 
 
 		 135 aa  90.9  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  38.35 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.1 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.35 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  44.07 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  43.7 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  40.66 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  38 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  37.16 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  30.72 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  37.72 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  32.08 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.27 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  36.5 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  36.75 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.07 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.21 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.77 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.72 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  39.29 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  37.11 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2201  hypothetical protein  38.83 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.61 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.11 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  32.38 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.48 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.82 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.33 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.23 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  28.66 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  32.4 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  32.32 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.83 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.04 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.9 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  28.85 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.29 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  35.14 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.74 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.78 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  32.69 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.66 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  29.94 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.13 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.78 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  27.75 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.74 
 
 		 219 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.04 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.61 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.51 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  29.57 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  27.75 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  40.51 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  29.63 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  34.57 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.27 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  29.73 
 
 		 253 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.12 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.82 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.48 
 
 		 147 aa  42  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  36.67 
 
 		 219 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  36.46 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  21.84 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>