98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1249 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  45.39 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  45.39 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.05 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  47.13 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  46 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.72 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.06 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  50.88 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  45.1 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  47.41 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  41.51 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  46.02 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  43.06 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  41.24 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.21 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.79 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  46.81 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  37.25 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.71 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.55 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  36.27 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  29.73 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.04 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.41 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.04 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.96 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  33.86 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  32.41 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.02 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  28.3 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  27.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.34 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.25 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  26.06 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  54.76 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  30.23 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  37.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  29.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.49 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  36.21 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  26.14 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.77 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.13 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.37 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.18 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  32.1 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.74 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.33 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.05 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  27.03 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  31.53 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.15 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  30.58 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.12 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.79 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 242 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0824  hypothetical protein  25.71 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.259993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.83 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.57 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.76 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.36 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.08 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  32.14 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  32.14 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.75 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  30.43 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  29.69 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.72 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  29.82 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  31.71 
 
 		 223 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.94 
 
 		 219 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 		 217 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  28.1 
 
 		 207 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.07 
 
 		 196 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.91 
 
 		 189 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2201  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.32 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  28.32 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.91 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.75 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  28 
 
 		 266 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.43 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  32.93 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  32.93 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.75 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>