115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2118 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  88.73 
 
 
204 aa  357  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  47.78 
 
 
206 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.63 
 
 
205 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38 
 
 
206 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.38 
 
 
209 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.69 
 
 
284 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  36.69 
 
 
273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.46 
 
 
226 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  38.78 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.29 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  29.75 
 
 
254 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.15 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.14 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.82 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  30.41 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.07 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  31.63 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  31.63 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.1 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  33.02 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.5 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.82 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  39.77 
 
 
137 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
222 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  31.58 
 
 
207 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.73 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.63 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.59 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.87 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.02 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  34 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.02 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.02 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.58 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.58 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  26.72 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.57 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  30.21 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  30.7 
 
 
1020 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.75 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.19 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.46 
 
 
158 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.84 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  31.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.25 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.84 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  29.81 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  27.13 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.81 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  30.83 
 
 
219 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.68 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  26.6 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  26.6 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.76 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  36.9 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  34.18 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
214 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  37.93 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  28.28 
 
 
163 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  28.4 
 
 
158 aa  45.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.3 
 
 
213 aa  44.7  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  29.11 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  32.14 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.29 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  26.43 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  32.93 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.28 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  29.63 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  33.73 
 
 
365 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  26.45 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  29.81 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>