91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02064 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  73.81 
 
 		 126 aa  186  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  49.35 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.42 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  41.67 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  45.1 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  40.52 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  46.15 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.49 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  41.67 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  35.95 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.85 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.41 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  46.3 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  32.45 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.11 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.6 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.38 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  34.04 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.19 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  35.11 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  39 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.38 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.65 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  32.39 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.65 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  30.94 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  35.96 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.1 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.67 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.62 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.94 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.23 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  28.57 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  35.19 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.41 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.4 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  38.89 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  35.56 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.78 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.18 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  30.36 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.94 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.47 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.71 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  31.71 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  30.59 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.55 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  33.72 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  26.32 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.93 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  33.06 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  32.11 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.67 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  29.11 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.91 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.05 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.44 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  31.82 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.38 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.12 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.49 
 
 		 219 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  26.61 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  30.49 
 
 		 182 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.06 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.81 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.63 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.1 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  30.49 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.71 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  28.57 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.63 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  29.82 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>