58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0345 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  33.96 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  32.46 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  33.67 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  32.95 
 
 		 285 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.38 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  37.74 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  35.96 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  32.5 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.91 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.7 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  30.43 
 
 		 279 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.98 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.12 
 
 		 219 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  31.52 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.52 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.36 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  37.65 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.35 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  32.53 
 
 		 206 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  32.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  32.29 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.13 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1081  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.39 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.95 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 		 220 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.74 
 
 		 226 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.59 
 
 		 284 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.57 
 
 		 204 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  30.59 
 
 		 273 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.57 
 
 		 204 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  37.84 
 
 		 167 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  32.18 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  30.11 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  29.7 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.74 
 
 		 222 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  29.7 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  30.68 
 
 		 266 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>