51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1015 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  41.75 
 
 
206 aa  159  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.06 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.27 
 
 
284 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  35.71 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.46 
 
 
204 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.46 
 
 
204 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.81 
 
 
205 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.89 
 
 
206 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  35.15 
 
 
206 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.11 
 
 
204 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.33 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.73 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.9 
 
 
185 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  35.42 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  34.48 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.3 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  29.69 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.69 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  29.69 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.97 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.73 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.48 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.92 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  33.78 
 
 
190 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.13 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.96 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  27.59 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.52 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  24.35 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.97 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.84 
 
 
216 aa  45.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  37.93 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  31.43 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  29.11 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
157 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.47 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  28.74 
 
 
126 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.28 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  32.47 
 
 
232 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.07 
 
 
220 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  31.31 
 
 
222 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
189 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
189 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
189 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>