110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3870 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
214 aa  433  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  77.03 
 
 
220 aa  315  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  67.31 
 
 
253 aa  307  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  72.64 
 
 
222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  69.23 
 
 
216 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.09 
 
 
215 aa  286  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.57 
 
 
216 aa  284  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  65.38 
 
 
221 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  67.94 
 
 
214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  64.02 
 
 
216 aa  281  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  61.68 
 
 
222 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.9 
 
 
221 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  64.15 
 
 
219 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  64.15 
 
 
219 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.15 
 
 
219 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.15 
 
 
219 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  63.55 
 
 
214 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  63.77 
 
 
209 aa  278  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  65.22 
 
 
220 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  65.22 
 
 
220 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.2 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.25 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.07 
 
 
222 aa  272  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  63.24 
 
 
1020 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  62.98 
 
 
215 aa  266  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.81 
 
 
216 aa  266  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.11 
 
 
224 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.29 
 
 
224 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  63.64 
 
 
221 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  57 
 
 
253 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  57 
 
 
253 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  57 
 
 
253 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.71 
 
 
218 aa  236  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  60.77 
 
 
217 aa  234  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  56.44 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  56.44 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  57.87 
 
 
210 aa  222  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.5 
 
 
220 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.46 
 
 
219 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  35.98 
 
 
216 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.87 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  34.26 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.08 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  27.97 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  37.38 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.36 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  32.11 
 
 
273 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.61 
 
 
198 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
284 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.76 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  25.93 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  28.74 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  29.47 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0145  hypothetical protein  36.47 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.11 
 
 
166 aa  49.3  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  32.26 
 
 
139 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  34.21 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.26 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.26 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  30.11 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  35.79 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.49 
 
 
202 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  31.86 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  39.24 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  39.24 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  31.96 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  27 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.12 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  31.87 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  36.36 
 
 
245 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  29.06 
 
 
167 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.17 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  38.27 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.17 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  29.57 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.94 
 
 
185 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.71 
 
 
158 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  27.45 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.97 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.66 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.88 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.29 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.11 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  26.13 
 
 
167 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  28.28 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.27 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.07 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  35.8 
 
 
279 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  32.18 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  29.57 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  39.22 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>