112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12464 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  63.7 
 
 
200 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  54.41 
 
 
198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  54.41 
 
 
198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  53.68 
 
 
207 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  52.59 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  52.31 
 
 
215 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  50.38 
 
 
209 aa  130  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  50.77 
 
 
224 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  55.37 
 
 
208 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  52.59 
 
 
210 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  50.42 
 
 
203 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54.24 
 
 
218 aa  116  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.28 
 
 
206 aa  113  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.24 
 
 
233 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  46.61 
 
 
202 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.28 
 
 
189 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
189 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.28 
 
 
189 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
189 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
189 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  32.46 
 
 
208 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
201 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.62 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.08 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.62 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  28.83 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.54 
 
 
213 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.53 
 
 
195 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.79 
 
 
196 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.72 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.59 
 
 
198 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
202 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  34.41 
 
 
253 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  36.17 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  26.88 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  26.88 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.17 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.17 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.17 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  35.23 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.21 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.46 
 
 
218 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  31.96 
 
 
214 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  23.62 
 
 
208 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.33 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.32 
 
 
222 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 
202 aa  48.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.21 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
1020 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  47.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.32 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.25 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.33 
 
 
195 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.21 
 
 
214 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.52 
 
 
166 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.9 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11162  hypothetical protein  39.19 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.29 
 
 
216 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.73 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.53 
 
 
214 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  31.52 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  31.52 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  30.3 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.12 
 
 
221 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.12 
 
 
221 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  28.81 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.41 
 
 
204 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  26.45 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  32.22 
 
 
253 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  32.22 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  32.22 
 
 
253 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  26.45 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.49 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.42 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.43 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.98 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  27.96 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.69 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  29.41 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.91 
 
 
216 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.84 
 
 
219 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.01 
 
 
227 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  29.57 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  30.77 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>