78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2834 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  93.01 
 
 
209 aa  339  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  61 
 
 
207 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  61.42 
 
 
198 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  61.42 
 
 
198 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  58.59 
 
 
200 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  56.78 
 
 
209 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  54.95 
 
 
208 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.47 
 
 
206 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.6 
 
 
218 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  46.23 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  52.59 
 
 
139 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54.63 
 
 
233 aa  138  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  44.61 
 
 
203 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  42.93 
 
 
215 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  42.86 
 
 
224 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.46 
 
 
208 aa  99  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  38.18 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.87 
 
 
194 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.23 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.71 
 
 
187 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.75 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.75 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.95 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.37 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.69 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.48 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.83 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.97 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  23.71 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  28.41 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  32.43 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  29.82 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.03 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.93 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  28.46 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  28.46 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.67 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.3 
 
 
222 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  28 
 
 
168 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  26.96 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.76 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.99 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.73 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.93 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  25.23 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.55 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.59 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  31.71 
 
 
186 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  26.04 
 
 
221 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.04 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.58 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  25.67 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.58 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.17 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  31.37 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  34.21 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.91 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  24.74 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.23 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.68 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.85 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
215 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.95 
 
 
184 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.17 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.52 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.47 
 
 
214 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>