117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4543 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.89 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  53.77 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  54.11 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  55.73 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  56.38 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  51.22 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  55.12 
 
 		 210 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  46.5 
 
 		 200 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  48.5 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  45.63 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  44.39 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  45.5 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  45.5 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.46 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  49.24 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  37.62 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  26.34 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  29.81 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.7 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.82 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.43 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.18 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.66 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.19 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.19 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  33.94 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.09 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.97 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.35 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  33.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.07 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.07 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.83 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.02 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  26.35 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  29.2 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  29.2 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  35.16 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  35.16 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  35.24 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  27.03 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.6 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  28.21 
 
 		 167 aa  48.5  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  31.17 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  33.03 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.98 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.16 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  39.47 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.56 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  26.06 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  26.06 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.39 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  29.46 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.94 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.19 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  30.61 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.08 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.15 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  29.91 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.97 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  30.63 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.65 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  30.49 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.71 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.56 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.91 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.19 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  31.71 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  29.49 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.84 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.52 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  41.25 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>