137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2713 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  93.24 
 
 
222 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  80.93 
 
 
216 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  81.98 
 
 
222 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  82.13 
 
 
214 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  81.82 
 
 
219 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  81.82 
 
 
219 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  81.82 
 
 
219 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  81.82 
 
 
219 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  77.67 
 
 
216 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  76.85 
 
 
216 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  77.67 
 
 
215 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.14 
 
 
215 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  61.64 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  64.42 
 
 
221 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.94 
 
 
221 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  62.56 
 
 
220 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  62.56 
 
 
220 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  61.17 
 
 
214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.24 
 
 
220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  268  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  62.38 
 
 
1020 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  60.85 
 
 
215 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.68 
 
 
214 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  59.01 
 
 
222 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  59.07 
 
 
216 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  62.02 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  60.55 
 
 
221 aa  252  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.2 
 
 
224 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.76 
 
 
218 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.55 
 
 
224 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  53.88 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  52.31 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  53.88 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  52.31 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  51.85 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  58.59 
 
 
210 aa  224  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.55 
 
 
220 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.65 
 
 
219 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  36.32 
 
 
216 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  43.3 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.65 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  42.27 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.84 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36 
 
 
185 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  37.66 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.61 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.46 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  39.76 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.78 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.21 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
196 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
219 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
219 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
219 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  25.76 
 
 
182 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  33.65 
 
 
273 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.78 
 
 
242 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  25.83 
 
 
215 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.96 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35 
 
 
198 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.38 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.16 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.76 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.69 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  33.61 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  31.43 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.55 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  39.47 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.44 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.18 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.52 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  27.1 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.73 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.72 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  34 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.21 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.11 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.85 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.21 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 
187 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  31.76 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.78 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  31.71 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.98 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32.22 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.13 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.58 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>