149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1466 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  93.24 
 
 
222 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  84.21 
 
 
219 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  84.21 
 
 
219 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  84.21 
 
 
219 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  84.21 
 
 
219 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  81.98 
 
 
222 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  80.93 
 
 
216 aa  364  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  82.61 
 
 
214 aa  357  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  77.67 
 
 
216 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  76.96 
 
 
216 aa  348  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  76.74 
 
 
215 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  67.76 
 
 
215 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  64.45 
 
 
221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.98 
 
 
221 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  59.91 
 
 
253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  62.56 
 
 
220 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  62.56 
 
 
220 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.89 
 
 
220 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  63.37 
 
 
1020 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  61.72 
 
 
209 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  59.71 
 
 
214 aa  266  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  61.57 
 
 
217 aa  258  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  59.91 
 
 
215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  57.94 
 
 
216 aa  256  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.2 
 
 
214 aa  255  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  59.01 
 
 
222 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.76 
 
 
218 aa  254  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  60.09 
 
 
221 aa  254  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.2 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.8 
 
 
224 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  52.56 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  52.56 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  52.31 
 
 
253 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  52.31 
 
 
253 aa  242  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  51.85 
 
 
253 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  57.58 
 
 
210 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.38 
 
 
220 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.03 
 
 
219 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  34.98 
 
 
216 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.11 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  30.77 
 
 
177 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  30.77 
 
 
177 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34 
 
 
185 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  34.82 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.91 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.49 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  38.46 
 
 
158 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  32.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.47 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.22 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  34.15 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  25.38 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.78 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.78 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.36 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.78 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.09 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.58 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.21 
 
 
204 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.67 
 
 
201 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  31.25 
 
 
273 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.09 
 
 
219 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  35.53 
 
 
209 aa  52  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  30.21 
 
 
204 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.11 
 
 
227 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.11 
 
 
213 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  27.88 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.78 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.07 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.36 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.98 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.81 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  32.32 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.46 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.66 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.74 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  26.05 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.76 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.85 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  34.38 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.51 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  34.38 
 
 
194 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  29.52 
 
 
207 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.12 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>