108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4254 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  324  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  96.57 
 
 
177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  28.5 
 
 
220 aa  87.8  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  28.5 
 
 
220 aa  87.8  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.28 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.63 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
216 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.29 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.96 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.96 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.96 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  42.27 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  42.27 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.93 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  30.46 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.84 
 
 
216 aa  74.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  43.3 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  43.3 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  30.1 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.1 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  41.24 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  27.09 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  28.06 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.89 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  25.89 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.39 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.64 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  32.64 
 
 
1020 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.51 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.69 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.64 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  37.14 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4265  hypothetical protein  46.09 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741794  decreased coverage  0.00881833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.78 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.73 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
195 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.73 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.96 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.04 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.36 
 
 
166 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.93 
 
 
214 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.46 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.18 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.55 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.16 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.35 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  35 
 
 
279 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  32.47 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
196 aa  47.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.96 
 
 
218 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
219 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.95 
 
 
219 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.15 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  35.44 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.79 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.01 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.66 
 
 
219 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.52 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.2 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.04 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.09 
 
 
218 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.37 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.75 
 
 
142 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.96 
 
 
217 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.63 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.21 
 
 
201 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.74 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.57 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  34.19 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  32.94 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  36.47 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.91 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.62 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.16 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.12 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.67 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.62 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.87 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  27.93 
 
 
232 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  32.5 
 
 
193 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  29.49 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.8 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  44.07 
 
 
214 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.8 
 
 
284 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  31.71 
 
 
245 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.91 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.79 
 
 
219 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>