105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5711 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  98.81 
 
 
253 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  77.73 
 
 
248 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  77.73 
 
 
248 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.29 
 
 
215 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  59.51 
 
 
209 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  57.21 
 
 
219 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  57.21 
 
 
219 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.21 
 
 
219 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.21 
 
 
219 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  56.82 
 
 
253 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  52.31 
 
 
222 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.31 
 
 
222 aa  242  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  55.3 
 
 
1020 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.71 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  55.83 
 
 
221 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  55.07 
 
 
214 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  55.34 
 
 
221 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.48 
 
 
218 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.4 
 
 
216 aa  234  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  56.59 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  55.67 
 
 
220 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  55.67 
 
 
220 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  55.02 
 
 
214 aa  229  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.14 
 
 
220 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57 
 
 
214 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  56.42 
 
 
224 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  54.37 
 
 
216 aa  224  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.59 
 
 
216 aa  224  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  56.65 
 
 
222 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.63 
 
 
215 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  49.76 
 
 
215 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  55.98 
 
 
224 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  53.81 
 
 
221 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  50.24 
 
 
217 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  49.01 
 
 
210 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.08 
 
 
220 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
219 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  35.18 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.12 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  33.64 
 
 
167 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.59 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  43.3 
 
 
177 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  42.42 
 
 
177 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30 
 
 
166 aa  55.8  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  41.89 
 
 
158 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.75 
 
 
189 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  43.75 
 
 
189 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.11 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  34.15 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.18 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.14 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.37 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.71 
 
 
196 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
188 aa  48.5  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  40.74 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.25 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.27 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.56 
 
 
189 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.8 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  41.77 
 
 
175 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  31.19 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.56 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.28 
 
 
284 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  26.32 
 
 
182 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.34 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.65 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.65 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.65 
 
 
189 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.24 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30 
 
 
185 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.7 
 
 
150 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.04 
 
 
158 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.66 
 
 
189 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.84 
 
 
242 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.91 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  36.96 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.16 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  30.93 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  34.62 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  36.36 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  27.43 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.67 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.23 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.84 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2905  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.7 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  hitchhiker  0.00729038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  35.65 
 
 
166 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  32.22 
 
 
139 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.88 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>