78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  58.79 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  58.59 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  58.59 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  58 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  58.33 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  56.78 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  52.53 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54.04 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  51.76 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.62 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  47.29 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  46.15 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.19 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  44.67 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.46 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.17 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.34 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  34.23 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.54 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.7 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  23.2 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.63 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.32 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.34 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.05 
 
 		 142 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.05 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.04 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.88 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  27.17 
 
 		 147 aa  51.6  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  27.1 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.2 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  23.89 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  23.89 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  28.85 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.2 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  35.9 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  26.05 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  25 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.71 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.17 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  26.8 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  29.58 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  27.08 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  27.08 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.03 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.03 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.03 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  27.18 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.19 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.38 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.13 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.13 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  30.95 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.66 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  30.12 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.74 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.27 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.13 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  34.15 
 
 		 137 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  28.83 
 
 		 207 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  30.53 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  30.53 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  33.67 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>