71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3804 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  51.72 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  42.05 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  32.47 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.7 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  30.65 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.2 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  31.71 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  28.35 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.26 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  38.18 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.24 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  34.19 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  34.19 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  33.91 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.48 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  32.46 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.63 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.23 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.81 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.04 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  31.62 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.44 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.52 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.78 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  35.23 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.56 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.04 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.24 
 
 		 135 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  34.88 
 
 		 133 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  29.15 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.88 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.24 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.26 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.89 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  34.48 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  42.05 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  29.03 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  29.03 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.78 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  28.09 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  33.77 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  30.16 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.71 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.92 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  34.09 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  34.44 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.15 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  29.06 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.72 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  31.11 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  32.05 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.68 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.5 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  28 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.74 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.26 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  29.73 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  34.83 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.17 
 
 		 202 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.26 
 
 		 219 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.77 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 152 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>