162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2035 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.11 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  45.95 
 
 
153 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  49.53 
 
 
133 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  46.3 
 
 
153 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  44 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  43 
 
 
153 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  42.48 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  42.48 
 
 
152 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  39.31 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  43.28 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  38.89 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.42 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  38.97 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  43.27 
 
 
144 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  34.86 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  38.3 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.31 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  43.64 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.36 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  41.49 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.88 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.6 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  37.76 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.78 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  39.29 
 
 
175 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.79 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  36.28 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  35.96 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.96 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  36.8 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  42.86 
 
 
59 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.45 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.95 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  38.39 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.56 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.05 
 
 
233 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.4 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  31.86 
 
 
158 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.12 
 
 
188 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.3 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.04 
 
 
226 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.12 
 
 
198 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  34.21 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  36.14 
 
 
219 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  30.59 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.53 
 
 
220 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.85 
 
 
242 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  30.59 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.19 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  30.09 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  35.06 
 
 
222 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.89 
 
 
214 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
218 aa  48.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.48 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.21 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  33.87 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  34.44 
 
 
208 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.88 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.84 
 
 
220 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  27.88 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.31 
 
 
189 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.44 
 
 
194 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  29.31 
 
 
189 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.22 
 
 
195 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
195 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
189 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
189 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
189 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.91 
 
 
157 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  32.99 
 
 
160 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  36.71 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 
219 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 
219 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.83 
 
 
219 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 
157 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.83 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  25.5 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  38.36 
 
 
238 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.08 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  37.08 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.29 
 
 
213 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.17 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.21 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.86 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.65 
 
 
216 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>