100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3315 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3464  hypothetical protein  73.38 
 
 		 155 aa  221  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2758  hypothetical protein  49.69 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0060401  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  33.54 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.99 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  30.61 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  35.67 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.76 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.56 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.21 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1249  membrane protein  30.87 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.7 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  28.77 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  33.96 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.06 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  31.08 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0819  hypothetical protein  29.61 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003725  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.17 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.74 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  31.19 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.14 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.46 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  34.82 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  29.58 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2035  hypothetical protein  33.62 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.984439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.14 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  27.21 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.17 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3074  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.73 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.94 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.45 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.61 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.3 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.66 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  33.04 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.75 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  28.83 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.83 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.97 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.22 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  23.33 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.69 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  29.89 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  25.27 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3338  hypothetical protein  29.59 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  26.73 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  26.76 
 
 		 285 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.86 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.81 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.92 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.18 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.41 
 
 		 202 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1081  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.97 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  30.38 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.48 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  26.8 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.88 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.52 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  28.09 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.21 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.41 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.41 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.41 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  26.47 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  27.19 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.96 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 250 aa  43.9  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.55 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  27.16 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  22.61 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  27.16 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.44 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  25.64 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.45 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  27.68 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  36.11 
 
 		 167 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.48 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2201  hypothetical protein  25.49 
 
 		 147 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.72 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02656  hypothetical protein  41.67 
 
 		 59 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.55 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  31.43 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.37 
 
 		 219 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  27.62 
 
 		 189 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.62 
 
 		 189 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  22.78 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.14 
 
 		 196 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>