81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3685 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  97.98 
 
 
198 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  97.98 
 
 
198 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  61 
 
 
210 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  58.79 
 
 
209 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  59.55 
 
 
209 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  56.06 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  51.92 
 
 
208 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.74 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  48.77 
 
 
215 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  48.48 
 
 
224 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  50 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  43.22 
 
 
202 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  53.68 
 
 
139 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  45.96 
 
 
203 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4543  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.17 
 
 
233 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5053  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.78 
 
 
208 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.28 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  26.42 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3804  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0213  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.26 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.76 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  34.57 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.52 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.27 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  23.38 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.59 
 
 
170 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  37.78 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  23.58 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.83 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  23.58 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  35.37 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.3 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.25 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.52 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.04 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  26.36 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.1 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.39 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.78 
 
 
213 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.93 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.93 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  32.91 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.93 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  26.04 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  30.95 
 
 
166 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.13 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  34.41 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.17 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.47 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  25.41 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.17 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  29.41 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  30.1 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  30.43 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  30.43 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.1 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.1 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.1 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.24 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.12 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.42 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  32.94 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.17 
 
 
196 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2331  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
184 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387796  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.09 
 
 
160 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.49 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  25.49 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 
159 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  31.97 
 
 
175 aa  41.2  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>