152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1533 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
218 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.19 
 
 
222 aa  270  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.73 
 
 
216 aa  266  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  61.76 
 
 
222 aa  266  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  61.43 
 
 
214 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  61.95 
 
 
214 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  58.85 
 
 
253 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  60.98 
 
 
219 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  60.98 
 
 
219 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.98 
 
 
219 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.98 
 
 
219 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.44 
 
 
216 aa  257  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.24 
 
 
222 aa  257  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  60.48 
 
 
253 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  60.48 
 
 
253 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  60 
 
 
253 aa  255  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  57.07 
 
 
221 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  56.59 
 
 
221 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.07 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  56.52 
 
 
209 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.5 
 
 
216 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62 
 
 
215 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  56.13 
 
 
248 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  56.13 
 
 
248 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.24 
 
 
220 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  54.5 
 
 
1020 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  59.81 
 
 
221 aa  243  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  57.14 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  58.74 
 
 
222 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  55.07 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.71 
 
 
214 aa  241  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  55.22 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  56.94 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  55.22 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.45 
 
 
224 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.49 
 
 
224 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  50.79 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.29 
 
 
220 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.41 
 
 
219 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  39.29 
 
 
216 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.11 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.56 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  32.35 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  36.46 
 
 
139 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  33.9 
 
 
273 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.05 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.29 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  28.93 
 
 
147 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.65 
 
 
166 aa  55.8  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.82 
 
 
185 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.74 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  32 
 
 
208 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.57 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.57 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  35.44 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.19 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  32 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  37.66 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 
189 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  31.37 
 
 
224 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  40.24 
 
 
245 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  37.04 
 
 
177 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.55 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.66 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  42.35 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  31.33 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.78 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  37.96 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  32.99 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.49 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  31.33 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  38.96 
 
 
90 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
170 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  31.68 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.87 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.45 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  34.25 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  36.25 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.67 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  38.2 
 
 
219 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.12 
 
 
219 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.97 
 
 
206 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  34.72 
 
 
157 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>